در دانشکده شیعه شناسی سه گروه علمی: شیعه شناسی (گرایش کلام شیعه) به زبان فارسی و انگلیسی، تاریخ و فرق تشیع مشغول فعالیت اند.
در "رشته شیعه شناسی" به هر دو زبان سرفصل ها و نیز پایان نامه ها غالبا معطوف به تاریخ و اندیشه کلام شیعه اند و اندیشه کلامی شیعه را، به صورت مستقل یا در مقایسه با ادیان و مذاهب دیگر مورد مطالعه قرار می دهند.
در رشته "تاریخ تشیع"، تاریخ اجتماعی، سیاسی، فرهنگی و احیانا اقتصادی شیعه مورد کاوش قرار می گیرد.
در رشته "فرق تشیع" از فرق موجود شیعه از قبیل: زیدیه، اسماعیلیه و نصیریه و فرق منقرض شده از قبیل فتحیه، کیسانیه و… بحث می کند.
بدین ترتیب شاید بتوان گفت این سه رشته مجموعا می توانند به پرسشهای ما درباره ابعاد مختلف تشیع پاسخگو باشند و از این طریق در ما خودآگاهی تاریخی نسبت به گذشته مان ایجاد کنند.
دانشکده شیعه شناسی در هر سه رشته مذکور هم در مقطع ارشد و هم در مقطع دکتری از طریق کنکور سراسری و آزمون اختصاصی، دانشجوی حضوری می پذیرد.